RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRC37A2A6NM11 1700 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 USP8P40818 1118 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 GPC3P51654 580 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 MFAP3P55082 362 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 CAP1Q01518 475 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 GUCY2DQ02846 1103 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ENPEPQ07075 957 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 CYP24A1Q07973 514 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 SREBF2Q12772 1141 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 NNTQ13423 1086 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 MTERF2Q49AM1 385 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 GPD1LQ8N335 351 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 KREMEN1Q96MU8 473 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ISCUQ9H1K1 167 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RAD51CO43502 376 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 PHACTR2O75167 634 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ATG7O95352 703 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 GGCXP38435 758 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 CNTN2Q02246 1040 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 PAK2Q13177 524 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 EMC2Q15006 297 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 EPS8L1Q8TE68 723 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 SHC3Q92529 594 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 BICD1Q96G01 975 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 SPATC1LQ9H0A9 340 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF302Q9NR11 478 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 FBXO40Q9UH90 709 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC188H7C350 402 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 AGPSO00116 658 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RNF40O75150 1001 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ERVK-9P63128 1117 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 HELQQ8TDG4 1101 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 NT5C1BQ96P26 610 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 PNMA3Q9UL41 463 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 COG5Q9UP83 839 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RTN2O75298 545 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 SGPL1O95470 568 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 OATP04181 439 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ATP4AP20648 1035 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 TCEAL1Q15170 157 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 EFCC1Q9HA90 598 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 RAB20Q9NX57 234 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 NFU1Q9UMS0 254 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-212ENST00000559974 ESYT3A0FGR9 886 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 ERICH4A6NGS2 130 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 CYP26A1O43174 497 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 TRPA1O75762 1119 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 GZMAP12544 262 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 CHRNB2P17787 502 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 CTGFP29279 349 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 SEPT14Q6ZU15 432 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 SV2AQ7L0J3 742 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 IFT81Q8WYA0 676 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNN1Q92952 543 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM213AQ9BRX8 229 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 AP1M1Q9BXS5 423 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF233A6NK53 670 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 KRIT1O00522 736 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 CLSTN1O94985 981 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 SCP2P22307 547 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 LIG4P49917 911 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 INHBEP58166 350 aa15.57■□□□□ 0.08
RABGGTA-212ENST00000559974 GPC5P78333 572 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms