RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530085.2

RDX-208, Transcript of radixin, human

TSL 3

Gene RDX, Length 793 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDX-208	ENST00000530085	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ARIH2	O95376	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	GAST	P01350	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	AMY1A	P04745	511 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	MYF5	P13349	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SYN1	P17600	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SREBF1	P36956	1147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	KIR2DL3	P43628	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	WNT3A	P56704	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	RAB1A	P62820	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	FGL2	Q14314	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	RAB39A	Q14964	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085		Q6ZUG5	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	TYR	P14679	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	HOXA5	P20719	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	MRE11	P49959	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	MEOX1	P50221	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PLS1	Q14651	629 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PHKB	Q93100	1093 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	APIP	Q96GX9	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	FRS3	O43559	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ITGA10	O75578	1167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	DDC	P20711	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	MAL	P21145	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	CRHR1	P34998	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	TLE1	Q04724	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	LPP	Q93052	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDX-208	ENST00000530085	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms