RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 TECTAO75443 2155 aa29.36■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.36■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 C2CD2LO14523 706 aa29.36■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 EDN1P05305 212 aa29.36■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 NPTX2P47972 431 aa29.36■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 CREMQ03060 361 aa29.36■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa29.36■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 KCNK18Q7Z418 384 aa29.35■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.35■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 PDCP20941 246 aa29.34■■■□□ 2.29
ODC1-204ENST00000446285 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa29.34■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 USTQ9Y2C2 406 aa29.34■■■□□ 2.29
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ODC1-204ENST00000446285 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.31■■■□□ 2.28
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ODC1-204ENST00000446285 GRM5P41594 1212 aa29.3■■■□□ 2.28
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ODC1-204ENST00000446285 ZBTB33Q86T24 672 aa29.29■■■□□ 2.28
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ODC1-204ENST00000446285 UROC1Q96N76 676 aa29.29■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 CDT1Q9H211 546 aa29.29■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.29■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 C2orf16Q68DN1 1984 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 MUC6Q6W4X9 2439 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 H0YCG3 227 aa29.28■■■□□ 2.28
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