RNA–Protein interactions for RNA: YPR080W

TEF1, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF1, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF1	YPR080W	YCR102C	P25608	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PPA2	P28239	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ERG9	P29704	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ATS1	P31386	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TEF1	YPR080W	PPQ1	P32945	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YBR096W	P38256	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	HPA3	P39979	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YER158C	P40095	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SYS1	P41544	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SAM50	P53969	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MIM1	Q08176	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MCH4	Q08268	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RRI1	Q12468	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	OPI3	P05375	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RIP1	P08067	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SPS2	P08459	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NAM2	P11325	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MCM1	P11746	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CDC23	P16522	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ERG8	P24521	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CNE1	P27825	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PRE4	P30657	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ACH1	P32316	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	AIM25	P47140	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	GPG1	P53130	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YLR152C	P54072	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	KEI1	Q06346	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PIN2	Q12057	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SWM1	Q12379	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YLR358C	O13565	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SOD2	P00447	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	URA3	P03962	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	LDB16	P25587	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	FLO10	P36170	1169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	LEU5	P38702	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SLZ1	P40167	298 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	REE1	P40893	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	BRR6	P53062	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	GIM3	P53900	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ATG21	Q02887	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RAX1	Q08760	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	INP53	Q12271	1107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ORT1	Q12375	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	FSH3	Q99369	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SEC62	P21825	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ATG22	P25568	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MLF3	P32047	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MCM10	P32354	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RPC34	P32910	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
TEF1	YPR080W	YHR122W	P38829	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	DLS1	P40366	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PAM16	P42949	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MNN5	P46982	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MSY1	P48527	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	MTL1	P53214	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	VHT1	P53241	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	HOL1	P53389	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CTF19	Q02732	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PET191	Q02772	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SDC1	Q03323	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NUP53	Q03790	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	NNT1	Q05874	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	ENV7	Q12003	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	HMS1	Q12398	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CDC34	P14682	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	CTA1	P15202	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	STE18	P18852	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PUP1	P25043	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	PPG1	P32838	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	SNC2	P33328	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	FRM2	P37261	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TEF1	YPR080W	APL3	P38065	1025 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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