RNA–Protein interactions for RNA: YMR228W

MTF1, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase specificity factor, yeast

Gene MTF1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTF1	YMR228W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MOB2	P43563	287 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	GAS2	Q06135	555 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	GRS2	Q06817	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	ICT1	Q12385	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	TFC7	Q12415	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SAL1	D6W196	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CSE2	P33308	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PFS1	P38872	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YIL067C	P40514	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CRZ1	P53968	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SUR7	P54003	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CTR3	Q06686	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PLP2	Q12017	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PPT2	Q12036	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SPS100	P13130	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PBN1	P25580	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	LDS1	P31379	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YPC1	P38298	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	GAA1	P39012	614 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YFR057W	P43625	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SLT2	Q00772	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	FSH2	Q05015	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	TAF10	Q12030	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	JID1	Q12350	301 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	COX4	P04037	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	ZRC1	P20107	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	IFM1	P25038	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	URA10	P30402	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MRX3	P38172	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MOB1	P40484	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	FIS1	P40515	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	ASG7	P46993	209 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	AIM23	P47015	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	VHT1	P53241	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SPO77	Q06134	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RSA1	Q08932	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CSM4	Q08955	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PER33	Q12144	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RAD50	P12753	1312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	POF1	P25576	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SDS24	P38314	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YJR012C	P47087	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PBA1	Q05778	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SFH1	Q06168	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	ATP16	Q12165	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SFM1	Q12314	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PMT2	P31382	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	PEX22	P39718	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	EGT2	P42835	1041 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	CDH1	P53197	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	MFG1	Q07684	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	GET4	Q12125	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	SNF8	Q12483	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	LAG2	Q92325	660 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MTF1	YMR228W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	DAL81	P21657	970 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	RAD51	P25454	400 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	BIR1	P47134	954 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	GMC1	Q04399	608 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	FAR10	Q06001	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	STE18	P18852	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	RPO26	P20435	155 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	GIT1	P25346	518 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MTF1	YMR228W	CHL4	P38907	458 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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