RNA–Protein interactions for RNA: YLR431C

ATG23, Transcript of Peripheral membrane protein required for autophagy and CVT, yeast

Gene ATG23, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG23	YLR431C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	EPT1	P22140	391 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MRPL25	P23369	157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MIC19	P43594	170 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SDT1	P53078	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	USE1	P53146	245 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YNL095C	P53932	642 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	ASI3	P53983	676 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YPL278C	Q08990	100 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YCT1	Q12235	531 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YEL045C	P32616	141 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SMP1	P38128	452 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	RRG9	P40156	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	INP1	Q03694	420 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	LOA1	Q06508	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	CHD1	P32657	1468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	JEN1	P36035	616 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	GIM3	P53900	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SDC1	Q03323	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	ATG15	P25641	520 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SEN34	P39707	275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	AVT7	P40501	490 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YJR079W	P47126	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	DCR2	Q05924	578 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	IMP1	P28627	190 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MAL32	P38158	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	FZO1	P38297	855 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MED8	P38304	223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MAL12	P53341	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	SEY1	Q99287	776 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	PGU1	P47180	361 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YGL262W	P53054	175 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	ATG17	Q06410	417 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	YOL029C	Q08187	201 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	RFM1	Q12192	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	RAX2	Q12465	1220 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG23	YLR431C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YCR025C	P25352	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	ZRT3	P34240	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	RIB1	P38066	345 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	RRT13	P40042	185 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	COX15	P40086	486 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YIL054W	P40524	105 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	ZRG17	P53735	605 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YPR098C	Q06089	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	POX1	P13711	748 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	STE18	P18852	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	EHD3	P28817	500 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	MIC12	P38341	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	CUE1	P38428	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	ECM34	P38728	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	MRS2	Q01926	470 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YMR31	P19955	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YIL012W	P40551	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YDL144C	Q07589	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	COQ10	Q08058	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YCR102C	P25608	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
ATG23	YLR431C	POP8	P38208	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YBR096W	P38256	230 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	YHI9	P38765	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG23	YLR431C	RAD17	P48581	401 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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