RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	ASK10	P48361	1146 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YGR042W	P53227	271 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PEX25	Q02969	394 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	NNT1	Q05874	261 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	FEX1	Q08913	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	URA3	P03962	267 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	EHD3	P28817	500 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	DBF20	P32328	564 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	DLS1	P40366	167 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	LOH1	P47055	219 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	FMP48	P53233	369 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	DID2	P69771	204 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PRM15	Q03262	622 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YDR249C	Q03787	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	TMS1	Q12116	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	TRM13	Q12383	476 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	CHO1	P08456	276 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PPA2	P28239	310 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	MRP17	P28778	131 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	LEU5	P38702	357 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	JAC1	P53193	184 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PET191	Q02772	108 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	MIM1	Q08176	113 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PRM4	Q12498	284 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	SNC2	P33328	115 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YKR073C	P36153	106 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	AVT7	P40501	490 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YIL060W	P40519	144 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	TIR3	P40552	269 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RSM27	P53305	110 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	ARG5,6	Q01217	863 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YLR352W	Q06479	807 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	BDS1	Q08347	646 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	ODC2	Q99297	307 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	MKS1	P34072	584 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	SLI1	P53304	468 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	NRM1	P53718	249 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	SAM50	P53969	484 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YOR385W	Q08909	290 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	COX1	P00401	534 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	CTA1	P15202	515 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	HXT2	P23585	541 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	SCO1	P23833	295 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	ADH7	P25377	361 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	NAT2	P37293	288 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	AIM46	P38885	310 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	CUP9	P41817	306 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	OTU1	P43558	301 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YIP4	P53093	235 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	POP6	P53218	158 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YGR126W	P53274	230 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	BUD25	P85052	153 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	KAP120	Q02932	1032 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	HEM25	Q07534	307 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YAL064W-B	O13512	126 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	URA6	P15700	204 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	GEP4	P38812	185 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YER010C	P40011	234 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	AGE1	Q04412	482 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	FEX2	Q08991	375 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	HMS1	Q12398	434 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	RRI1	Q12468	440 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GGA2	YHR108W	PET18	P25362	215 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	NFS1	P25374	497 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	QDR1	P40475	563 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	IDP2	P41939	412 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	NIT2	P47016	307 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	BXI1	P48558	297 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	ISU1	Q03020	165 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	DLT1	Q04216	342 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	CTS2	Q06350	511 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GGA2	YHR108W	FRE7	Q12333	620 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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