RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	BUL1	P48524	976 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	PKP2	P53170	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	RSM27	P53305	110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	SNO1	Q03144	224 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	GRC3	Q07845	632 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	TEN1	Q07921	160 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	PUS9	Q12069	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	BSC1	Q12140	328 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PDI1	YCL043C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RAS1	P01119	309 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SEC12	P11655	471 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SEC59	P20048	519 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	FUN26	P31381	517 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MSK1	P32048	576 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	DOA4	P32571	926 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SKN1	P33336	771 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SPT10	P35208	640 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MRPL15	P36523	253 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SCO2	P38072	301 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PAU24	P38155	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YHR177W	P38867	453 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YJR096W	P47137	282 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RAD17	P48581	401 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	TIM21	P53220	239 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PAU12	P53343	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	TPP1	Q03796	238 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SPC19	Q03954	165 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	KEI1	Q06346	221 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MED7	Q08278	222 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ATX2	Q12067	313 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	CDC9	P04819	755 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	STE7	P06784	515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RPD3	P32561	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YKL107W	P34251	309 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SRX1	P36077	127 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	BNA4	P38169	460 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SHG1	P38337	142 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	FMO1	P38866	432 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	CHL4	P38907	458 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YAL037W	P39728	267 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	AGE2	P40529	298 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	CAT5	P41735	233 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PAC10	P48363	199 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	FHN1	P53279	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	HCH1	P53834	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
PDI1	YCL043C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ELP6	Q04868	273 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RNH202	Q05635	350 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YFT2	Q06676	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	NDE2	Q07500	545 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	INP53	Q12271	1107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YPK2	P18961	677 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PCL2	P25693	308 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YIM1	P28625	365 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ATS1	P31386	333 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MKK1	P32490	508 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	MTH1	P35198	433 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	DOA1	P36037	715 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SDH4	P37298	181 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	DTR1	P38125	572 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	POP8	P38208	133 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	FAU1	P40099	211 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YIL165C	P40446	119 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	SNM1	P40993	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	POP1	P41812	875 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	HXT14	P42833	540 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	NIT2	P47016	307 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	DAN1	P47178	298 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	YGR079W	P53249	370 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PDI1	YCL043C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

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