RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	COX17	Q12287	69 aa		4.09	□□□□□ -1.75
POP4	YBR257W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MAS2	P11914	482 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MER1	P16523	270 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DAL81	P21657	970 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	STE50	P25344	346 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DCC1	P25559	380 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	AHC2	P25649	128 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SCM4	P32564	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SUA5	P32579	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PMT1	P33775	817 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
POP4	YBR257W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MRPL37	P36532	105 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RTC2	P38279	296 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	POG1	P40473	351 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FMC1	P40491	155 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PAM16	P42949	149 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	BNA1	P47096	177 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	AIM25	P47140	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ERV14	P53173	138 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SAY1	P53324	424 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ASI3	P53983	676 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SNO1	Q03144	224 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	KEI1	Q06346	221 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	IPK1	Q06667	281 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SCP1	Q08873	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	INP53	Q12271	1107 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SUL2	Q12325	893 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	EAF3	Q12432	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.08	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	COX3	P00420	269 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	GAL80	P04387	435 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CDC21	P06785	304 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MSF1	P08425	469 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ERD1	P16151	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SEC22	P22214	214 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	IFM1	P25038	676 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	BUB3	P26449	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	TKL2	P33315	681 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ECT1	P33412	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	TIP20	P33891	701 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MIA40	P36046	403 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SLM1	P40485	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PHB2	P50085	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YGR117C	P53270	476 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MEP3	P53390	489 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	GOR1	P53839	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RTT103	Q05543	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RNH202	Q05635	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YPD1	Q07688	167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RDI1	Q12434	202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	NAM2	P11325	894 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MRP17	P28778	131 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MRP20	P32387	263 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PTR2	P32901	601 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	YOX1	P34161	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	SFK1	P35735	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
POP4	YBR257W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	AXL2	P38928	823 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	CAT5	P41735	233 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MNT4	P53745	580 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	MEH1	Q02205	184 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	OST6	Q03723	332 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	TMS1	Q12116	473 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PER33	Q12144	273 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	PST1	Q12355	444 aa		4.06	□□□□□ -1.76
POP4	YBR257W	FRE6	Q12473	712 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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