RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526001.1

CSF1-208, Transcript of colony stimulating factor 1, human

TSL 4

Gene CSF1, Length 573 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSF1-208	ENST00000526001	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.8	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	LAD1	O00515	517 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	C2CD2L	O14523	706 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	EFEMP2	O95967	443 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	SOD2	P04179	222 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	PRPH	P41219	470 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	MAPK6	Q16659	721 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.79	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001		H3BQV1	296 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	ACKR2	O00590	384 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	N4BP3	O15049	544 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	KLRC2	P26717	231 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	MCM2	P49736	904 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	DAW1	Q8N136	415 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.78	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.77	□□□□□ -0.2
CSF1-208	ENST00000526001	PTGES	O14684	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	HIP1R	O75146	1068 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	UROD	P06132	367 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	CLCN4	P51793	760 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	PEX3	P56589	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	ITIH3	Q06033	890 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	GRIK3	Q13003	919 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	MAPK7	Q13164	816 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	EDA	Q92838	391 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	PLIN2	Q99541	437 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.77	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	TEX28	O15482	410 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	RECQL4	O94761	1208 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	MYB	P10242	640 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	NPTX2	P47972	431 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	GLUD2	P49448	558 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	CABP7	Q86V35	215 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	GDA	Q9Y2T3	454 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001		K7ERI5	159 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	NR1I2	O75469	434 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	MTHFR	P42898	656 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	EFNA5	P52803	228 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	ZXDA	P98168	799 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	DSG1	Q02413	1049 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	NAB2	Q15742	525 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	HYI	Q5T013	277 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		13.75	□□□□□ -0.21
CSF1-208	ENST00000526001	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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