RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	UBXN1	Q04323	297 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT3	Q09327	533 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	BFSP1	Q12934	665 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX17	Q15036	470 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DPF3	Q92784	378 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC51	Q96ER9	411 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529		M0QZ92	97 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	COL6A1	P12109	1028 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	KRT13	P13646	458 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CHMP4BP1	P59074	171 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SURF1	Q15526	300 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALT5	O43286	388 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ERLIN2	O94905	339 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CD4	P01730	458 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CHRNA1	P02708	482 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	VAMP7	P51809	220 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	AP3M2	P53677	418 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GSDMD	P57764	484 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM14	Q14142	442 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMD6	Q15008	389 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	BRCA2	P51587	3418 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PQJ5	194 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CLTA	P09496	248 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CD302	Q8IX05	232 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	OSMR	Q99650	979 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CDT1	Q9H211	546 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	MYH11	P35749	1972 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529		H0YGN5	161 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR182	O15218	404 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALT4	O60513	344 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	FMO5	P49326	533 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	CETN1	Q12798	172 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRAF4-208	ENST00000469529	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.85	□□□□□ -0.19

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