RNA–Protein interactions for RNA: YPR079W

MRL1, Transcript of Membrane protein, yeast

Gene MRL1, Length 1,146 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRL1	YPR079W	VPS51	P36116	164 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	CAF4	P36130	643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	PHO90	P39535	881 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	IBA57	P47158	497 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	RMR1	P53060	241 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	REX4	Q08237	289 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	EXO70	P19658	623 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	PBN1	P25580	416 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	SIN4	P32259	974 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	ECM25	P32525	599 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
MRL1	YPR079W	YKL071W	P36086	256 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	ROT2	P38138	954 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	PAC11	P40960	533 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	PRM10	P42946	383 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	ATG27	P46989	271 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YJR154W	P47181	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YDL186W	P48568	277 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YNL234W	P53857	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	OCA2	P53949	197 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	STD1	Q02794	444 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	CTS2	Q06350	511 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	ESA1	Q08649	445 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	BTS1	Q12051	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	SAS5	Q99314	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MRL1	YPR079W	YPR096C	O13587	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	COX2	P00410	251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	SCEI	P03882	235 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	COR1	P07256	457 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	HXT2	P23585	541 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	YPS1	P32329	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
MRL1	YPR079W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	SPO23	P33757	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	SPT10	P35208	640 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	DOA1	P36037	715 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RSM22	P36056	628 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	CBP4	P37267	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	AYR1	P40471	297 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	AZF1	P41696	914 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	FMP33	P46998	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	STE24	P47154	453 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	ROG1	P53118	685 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	DUG3	P53871	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	MMT1	Q03218	510 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RAX1	Q08760	435 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	MMT2	Q08970	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	ZRC1	P20107	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	REC114	P32841	428 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	YBR062C	P38239	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	LAG1	P38703	411 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	SBE22	P38814	852 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	ALP1	P38971	573 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	ABM1	P47146	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	TRM9	P49957	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	PKP2	P53170	491 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	YNL181W	P53878	407 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	MET31	Q03081	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	IZH1	Q03419	316 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	FMN1	Q03778	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	COX20	Q04935	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	GLO2	Q05584	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	VPS74	Q06385	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	YEH2	Q07950	538 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	SGT1	Q08446	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RAD7	P06779	565 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	DST1	P07273	309 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	LDB16	P25587	256 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	ATP7	P30902	174 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	SNC1	P31109	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MRL1	YPR079W	ATO2	P32907	282 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms