RNA–Protein interactions for RNA: YOR353C

SOG2, Transcript of Key component of the RAM signaling network, yeast

Gene SOG2, Length 2,376 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOG2	YOR353C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PFA5	Q03289	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MDM32	Q12171	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPT6	Q99260	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RPB5	P20434	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	NDC1	P32500	655 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YOX1	P34161	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SLM4	P38247	162 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	TRM5	P38793	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	NTA1	P40354	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YIR035C	P40579	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	AZF1	P41696	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MRK1	P50873	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PRM15	Q03262	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SCS7	Q03529	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	TVP15	Q03860	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	COS7	Q07788	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	NSL1	Q12143	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YCR051W	P25631	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YKR073C	P36153	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YER121W	P40076	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	FAR3	P46671	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YJL043W	P47053	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PMT5	P52867	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SLD3	P53135	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SCW11	P53189	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YGR079W	P53249	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	OCA2	P53949	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	ACL4	Q03771	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	CSM4	Q08955	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	APC9	Q12107	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	SFM1	Q12314	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	FLP1	P03870	423 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	PET54	P10834	293 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	ERG3	P32353	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YOR062C	P36025	268 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MRPL3	P36516	390 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	FAD1	P38913	306 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	ATF1	P40353	525 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	AYR1	P40471	297 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	XBP1	P40489	647 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	ECO1	P43605	281 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YAP6	Q03935	383 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	HNT3	Q08702	217 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	ATP14	Q12349	124 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	YOP1	Q12402	180 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SOG2	YOR353C	MEC1	P38111	2368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	YGR201C	P42936	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ATG4	P53867	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ATG21	Q02887	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	PEX10	Q05568	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	FDH1	Q08911	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	SAS5	Q99314	248 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	FLO9	P39712	1322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ERD1	P16151	362 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ICS2	P38284	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	RMD6	P39975	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	MAM33	P40513	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	PPT1	P53043	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ERV14	P53173	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	YNR040W	P53736	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	RHO4	Q00246	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	CCA1	P21269	546 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	STE50	P25344	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	YCL042W	P25572	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	LDS1	P31379	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	ARO7	P32178	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SOG2	YOR353C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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