RNA–Protein interactions for RNA: YNL028W

YNL028W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL028W, Length 318 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL028W	YNL028W	ACB1	P31787	87 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	KRE6	P32486	720 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	MCH2	P36032	473 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	GLE2	P40066	365 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	AVT7	P40501	490 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	RPE1	P46969	238 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	YJL118W	P47022	219 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.28	□□□□□ -2.36
YNL028W	YNL028W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SGA1	P08019	549 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	IFM1	P25038	676 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YKR045C	P36138	183 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	PEP8	P40335	379 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	IRC4	Q03036	179 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	ECM18	Q04623	453 aa		0.27	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	RAD7	P06779	565 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	PUP2	P32379	260 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	UBC13	P52490	153 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	COG7	P53195	279 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	BUR2	Q05949	395 aa		0.26	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	COT1	P32798	439 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YHR035W	P38769	630 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YGR016W	P53209	190 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	PUT1	P09368	476 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	POX1	P13711	748 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SCM4	P32564	187 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	ZRT1	P32804	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	not detected
YNL028W	YNL028W	POP8	P38208	133 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	PHO89	P38361	574 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SEN34	P39707	275 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YGL114W	P53134	725 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YGR168C	P53293	376 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YNL146W	P53906	100 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	CAB5	Q03941	241 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YDR262W	Q12331	272 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	ERG2	P32352	222 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SFC1	P33303	322 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	CAJ1	P39101	391 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	CIS3	P47001	227 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	SNX4	P47057	423 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	OKP1	P53298	406 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	PEX12	Q04370	399 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	AEP1	P32493	518 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YKL162C	P36052	402 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	DAD2	P36162	133 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	ARN2	P38724	620 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	INA22	P40576	216 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	DAD3	P69850	94 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YNL028W	YNL028W	YGL010W	P25338	174 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	CSG2	P35206	410 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	GDS1	P41913	522 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	SWC4	P53201	476 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	AAH1	P53909	347 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	SKS1	Q12505	502 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	YBR220C	P38318	560 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	SPT8	P38915	602 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	MDM34	P53083	459 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	YOR114W	Q12219	294 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	GEP5	Q12393	293 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	PPH21	P23594	369 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	TAD2	P47058	250 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	YML018C	Q03730	393 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	DPP1	Q05521	289 aa		0.19	□□□□□ -2.38
YNL028W	YNL028W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67 ms