RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PDX1P16451 410 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C ERG9P29704 444 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MCM10P32354 571 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C COQ2P32378 372 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C DUT1P33317 147 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C ECT1P33412 323 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YKR015CP36111 568 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YBR063CP38083 404 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C CHK1P38147 527 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C VBA2P38358 474 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YHR035WP38769 630 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C EFM3P47163 339 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RPN14P53196 417 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YDL218WQ07629 317 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MIM1Q08176 113 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C NIP7Q08962 181 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YPL272CQ08984 517 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RBD2Q12270 262 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YLR122CQ12312 125 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa5.07□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C KIN28P06242 306 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C SEC12P11655 471 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PTC6P25646 442 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RPL5P26321 297 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C CAM1P29547 415 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MTC6P38849 526 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RIX1P38883 763 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YER184CP39961 794 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C BUR6P40096 142 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C SFH5P47008 294 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C UBX6P47049 396 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C HSV2P50079 448 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PCP1P53259 346 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C NUP116Q02630 1113 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C SRP1Q02821 542 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MAK3Q03503 176 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PLB2Q03674 706 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C BNA7Q04066 261 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C HRI1Q05905 244 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C NEJ1Q06148 342 aa5.06□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C CDC39P25655 2108 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PHO2P07269 559 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C NFT1P0CE68 1218 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C CDC34P14682 295 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C TAL1P15019 335 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C CPR2P23285 205 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RPS5P26783 225 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C ARO7P32178 256 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C SOF1P33750 489 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C DTR1P38125 572 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C THI2P38141 450 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YMR262WP38430 313 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PHO90P39535 881 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PCL6P40038 420 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C DDI1P40087 428 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PFS2P42841 465 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PAM16P42949 149 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C IRC5P43610 853 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C SAY1P53324 424 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C BSC5P53755 489 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C KAP120Q02932 1032 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YDR102CQ03864 110 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C HLR1Q04429 423 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C FMP42Q04991 504 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YOL114CQ12322 202 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C SFG1Q12507 346 aa5.05□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C STE50P25344 346 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C ATG15P25641 520 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MTC2P34246 357 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C NNK1P36003 928 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PTH1P38876 190 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C NVJ1P38881 321 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C IES5P40060 125 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C FMC1P40491 155 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C POP1P41812 875 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C ADO1P47143 340 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C VOA1P53262 265 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C GAL83Q04739 417 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C COQ11Q05892 277 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C CTS2Q06350 511 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C YDL114WQ07530 308 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C AIM6Q07716 390 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C MCH4Q08268 501 aa5.04□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C HMG1P12683 1054 aa5.03□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C STE18P18852 110 aa5.03□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PRE7P23724 241 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6not detected
RRP4YHR069C YPK3P38070 525 aa5.03□□□□□ -1.6
RRP4YHR069C GPI16P38875 610 aa5.03□□□□□ -1.6
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