RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W LCB4Q12246 624 aa4.78□□□□□ -1.64
CYK3YDL117W SEC22P22214 214 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PPA2P28239 310 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W UGA4P32837 571 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W OMA1P36163 345 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MRPL28P36527 147 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CHS7P38843 316 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W NPP2P39997 493 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HIT1P46973 164 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SFH5P47008 294 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W IKS1P47042 667 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CLD1P53264 445 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ARG5,6Q01217 863 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ELC1Q03071 99 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W IPK1Q06667 281 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W FCY22Q12119 530 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLR126CQ12288 251 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W COA6Q3E846 104 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CYC7P00045 113 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPB3P16370 318 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W STE4P18851 423 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YCL049CP25577 312 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MSK1P32048 576 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HXT4P32467 576 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W WBP1P33767 430 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ZRT3P34240 503 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YKL071WP36086 256 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ARN2P38724 620 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data4.77□□□□□ -1.65not detected
CYK3YDL117W PNT1P38969 423 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ZAP1P47043 880 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GOT1Q03554 138 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ASR1Q06834 288 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SWT1Q12104 458 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W NBP2Q12163 236 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TY1A-BLQ12266 440 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GPM3Q12326 303 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ATG5Q12380 294 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W VMA9Q3E7B6 73 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HBN1Q96VH4 193 aa4.77□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SGA1P08019 549 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W HEM13P11353 328 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PHO80P20052 293 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YCL068CP25593 260 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SEC17P32602 292 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CBP4P37267 147 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MDM31P38880 579 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W OXA1P39952 402 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PTR3P43606 678 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YMR160WQ03823 816 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TEN1Q07921 160 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W IRC10Q08118 586 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PST1Q12355 444 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ERP3Q12403 225 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YIL134C-AQ45U18 67 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W Q0142Q9ZZW4 58 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SUC2P00724 532 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ADH3P07246 375 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YBL086CP38177 466 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W DBP8P38719 431 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YER188WP40103 239 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YER189WP40104 122 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ROD1Q02805 837 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W CCE1Q03702 353 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TY1A-MR1Q04215 440 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YDR306CQ06640 478 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W AIM39Q08223 395 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W FRE8Q12209 686 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W SPE4Q12455 300 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa4.76□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
CYK3YDL117W ATG15P25641 520 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YSC84P32793 468 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W REG2P38232 338 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YHL044WP38727 235 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YIL060WP40519 144 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W AAD14P42884 376 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YFL064CP43540 174 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TAD1P53065 400 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W STR3P53101 465 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ASI3P53983 676 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W TIM8P57744 87 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W YLR446WQ06204 433 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W GUD1Q07729 489 aa4.75□□□□□ -1.65
CYK3YDL117W AHA1Q12449 350 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.6 ms