RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 IKBKBO14920 756 aa32.4■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 CXCL10P02778 98 aa32.4■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 CSF2RAP15509 400 aa32.4■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa32.4■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 SMTNL1A8MU46 457 aa32.39■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 BECN2A8MW95 431 aa32.39■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 LIG4P49917 911 aa32.39■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PIGRP01833 764 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ATF7IP2Q5U623 682 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL10Q6JEL2 608 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ZPBP2Q6X784 338 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 DBF4BQ8NFT6 615 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 BADQ92934 168 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD10Q9H3F6 313 aa32.38■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TISP43B9A030 160 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 AXLP30530 894 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R2P41236 205 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 GBP3Q9H0R5 595 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TMX1Q9H3N1 280 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD63C9JTQ0 380 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PSMA7O14818 248 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TGFB1I1O43294 461 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 CAPN15O75808 1086 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 SLC39A4Q6P5W5 647 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 SEPT8Q92599 483 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 VWCEQ96DN2 955 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 NR2E3Q9Y5X4 410 aa32.37■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1B0GUA9 196 aa32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 NOTUMQ6P988 496 aa32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 AOPEPQ8N6M6 819 aa32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 SEMA6BQ9H3T3 888 aa32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PDZD7Q9H5P4 517 aa32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TNFSF13BQ9Y275 285 aa32.36■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 EEF1DP3Q658K8 133 aa32.35■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 CHST12Q9NRB3 414 aa32.35■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa32.35■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 CTNND2Q9UQB3 1225 aa32.35■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TOM1L1O75674 476 aa32.34■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 APBB2Q92870 758 aa32.34■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PTPRHQ9HD43 1115 aa32.34■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PDXKO00764 312 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 MGEA5O60502 916 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 MYL5Q02045 173 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 FPGSQ05932 587 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TCTN1Q2MV58 587 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 CENPPQ6IPU0 288 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 HS2ST1Q7LGA3 356 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 NELFBQ8WX92 580 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 P2RX5Q93086 422 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TCHPQ9BT92 498 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 N4BP3O15049 544 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 PROZP22891 400 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa32.33■■■□□ 2.77
ECHS1-201ENST00000368547 ABLIM1O14639 778 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CLDN3O15551 220 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CCNE1P24864 410 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 RGS19P49795 217 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PMS1P54277 932 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TPM4P67936 248 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PAK1Q13153 545 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP32.32■■■□□ 2.762e-6■■■■□ 21.6
ECHS1-201ENST00000368547 DSC3Q14574 896 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 NCAPHQ15003 741 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF568Q3ZCX4 644 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 SLC27A1Q6PCB7 646 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 MPZL3Q6UWV2 235 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ADAM2Q99965 735 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 FTHL17Q9BXU8 183 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 HAPLN2Q9GZV7 340 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 IL23AQ9NPF7 189 aa32.32■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM49BA6NDI0 452 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CLIC2O15247 247 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ACRP10323 421 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ADSSP30520 456 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ZCWPW2Q504Y3 356 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CNKSR3Q6P9H4 555 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB33Q86T24 672 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC51Q96ER9 411 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 ADPGKQ9BRR6 497 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 STYXL1Q9Y6J8 313 aa32.31■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 PFKMP08237 780 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 STX17P56962 302 aa32.3■■■□□ 2.76
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
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