RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C17orf99Q6UX52 265 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFG1LQ8WV93 481 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCCD1A6NED2 376 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF5AQ12840 1032 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC18A3Q16572 532 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZPBP2Q6X784 338 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.75■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 F8VZ95 297 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PJA2O43164 708 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMPD1P17405 629 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAT1P42224 750 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJB7Q6PEY0 223 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM8AQ9HCN3 771 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM10Q9UDY6 481 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL1A2P08123 1366 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EVPLQ92817 2033 aa23.74■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF233A6NK53 670 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FERP16591 822 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT39Q6A163 491 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC35F6Q8N357 371 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C22orf31O95567 290 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOX5P35711 763 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLDN10P78369 228 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARID5AQ03989 594 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTK2Q05397 1052 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPIHBP1Q8IV16 184 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP6NLQ92738 828 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC102AQ96A19 550 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A0B4J269 797 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASAP2O43150 1006 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MSCO60682 206 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEA1P43355 309 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SREBF2Q12772 1141 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC127Q96BQ5 260 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR88Q9GZN0 384 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFR2Q9UP52 801 aa23.72■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE9A4FU28 777 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEB2O15479 319 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EDN1P05305 212 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INSRRP14616 1297 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFDP1Q14186 410 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMD6Q15008 389 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF149Q8NC42 400 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.71■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GFPT2O94808 682 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP3P08254 477 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBB2AQ13885 445 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERO1AQ96HE7 468 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFKBIZQ9BYH8 718 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.7■■□□□ 1.39
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATP8B3O60423 1300 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A087X0T9 212 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC172P0C7W6 258 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM228BP0C875 321 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPC3P51654 580 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POU5F1BQ06416 359 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSC1Q92574 1164 aa23.7■■□□□ 1.38
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms