RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	AIM23	P47015	356 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YJL045W	P47052	634 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SNN1	P48232	102 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	AVT4	P50944	713 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YGL114W	P53134	725 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PEX31	P53203	462 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SLM2	P53955	656 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YDR366C	P87287	132 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TDA1	Q03533	586 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SNO4	Q04902	237 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	FDH1	Q08911	376 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	HSP32	Q08992	237 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	DAP1	Q12091	152 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	UPC2	Q12151	913 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		5.13	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	FUN14	P18411	198 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YCK1	P23291	538 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YCR015C	P25616	317 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	URK1	P27515	501 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	COQ3	P27680	312 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	OCH1	P31755	480 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	DRE2	P36152	348 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	LDB7	P38210	180 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YBR013C	P38215	129 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ALP1	P38971	573 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	LAS21	P40367	830 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YJL107C	P42947	387 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MNN5	P46982	586 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	UBC7	Q02159	165 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	EST2	Q06163	884 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	DCI1	Q08558	271 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	NBP2	Q12163	236 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YER152C	P10356	443 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ERS1	P17261	260 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	NFS1	P25374	497 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ADH7	P25377	361 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RER2	P35196	286 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YPC1	P38298	316 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	UME6	P39001	836 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SLZ1	P40167	298 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MOB1	P40484	314 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YCH1	P42937	148 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TAH11	P47112	604 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	INN1	P53901	409 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TIM8	P57744	87 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	STP1	Q00947	519 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	KIN4	Q01919	800 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ATG21	Q02887	496 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	AAD4	Q07747	329 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ATG10	Q07879	167 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	IRC10	Q08118	586 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RIM20	Q12033	661 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YOR029W	Q12243	111 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RGT2	Q12300	763 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YPR1	Q12458	312 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SFG1	Q12507	346 aa		5.12	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	COR1	P07256	457 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ERG11	P10614	530 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CUP2	P15315	225 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SPO12	P17123	173 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	ATP10	P18496	279 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PCL2	P25693	308 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CDC20	P26309	610 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	EHD3	P28817	500 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	NUP2	P32499	720 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	TRS65	P32893	560 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	PRY2	P36110	329 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	THI2	P38141	450 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	REG2	P38232	338 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RRG9	P40156	214 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	GTS1	P40956	396 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	BIT61	P47041	543 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CPR7	P47103	393 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MRH4	P53166	561 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	MRPL22	P53881	309 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	RSC9	Q03124	581 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YMR160W	Q03823	816 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	SHH3	Q04487	196 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	CNL1	Q06333	122 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	YDR018C	Q12185	396 aa		5.11	□□□□□ -1.59
VBA1	YMR088C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms