RNA–Protein interactions for RNA: YLR178C

TFS1, Transcript of Inhibitor of carboxypeptidase Y (Prc1p), and Ras GAP (Ira2p), yeast

Gene TFS1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFS1	YLR178C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	GPX1	P36014	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	CHS7	P38843	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YIL169C	P40442	995 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	HXT9	P40885	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	IDS2	P46958	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	MDE1	P47095	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	MRK1	P50873	501 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	PRM8	P53174	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	HXT11	P54862	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	DML1	Q03652	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	GAS2	Q06135	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	TMA10	Q06177	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	HER1	Q12276	1246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	APC2	Q12440	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	LAS17	Q12446	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TFS1	YLR178C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	TIM12	P32830	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	XBP1	P40489	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	QRI7	P43122	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YNR062C	P53748	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	COS1	P53822	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YNL092W	P53934	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SNO4	Q04902	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	LOT6	Q07923	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	CRT10	Q08226	957 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	HSP32	Q08992	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	BTS1	Q12051	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	NFI1	Q12216	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	FLO9	P39712	1322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SIR3	P06701	978 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	CTA1	P15202	515 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SNF6	P18888	332 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YPK2	P18961	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	UTR1	P21373	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	AST1	P35183	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	ECM15	P35195	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SLM4	P38247	162 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	PEX18	P38855	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
TFS1	YLR178C	SPO73	P40031	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	BUD8	P41698	603 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	AGP3	P43548	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	TAF4	P50105	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YGR126W	P53274	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	MKC7	P53379	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	COQ10	Q08058	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	UIP4	Q08926	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	RLM1	Q12224	676 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	MET2	P08465	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	MDH2	P22133	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	MRPL6	P32904	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YKL071W	P36086	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	CHK1	P38147	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SRO77	P38163	1010 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SBE22	P38814	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	GET2	P40056	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SNL1	P40548	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	IRC7	P43623	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	MSY1	P48527	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YGL101W	P53144	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SNF12	P53628	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	SPC3	Q12133	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	TAF3	Q12297	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YLR358C	O13565	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	ATR1	P13090	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YCR100C	P25606	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	TRS65	P32893	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YBR138C	P38277	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	YEL068C	P39977	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	KRE29	P40026	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	POP1	P41812	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TFS1	YLR178C	BRR6	P53062	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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