RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GINS2Q9Y248 185 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GDAQ9Y2T3 454 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TRPV2Q9Y5S1 764 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PTPRSQ13332 1948 aa7.37□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 A0A087WZ62 844 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 K7ERI5 159 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PSMA7O14818 248 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GPR32O75388 356 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R37O75864 691 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FGBP02675 491 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CXCL10P02778 98 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MYBP10242 640 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GHRP10912 638 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PRCPP42785 496 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CASP5P51878 434 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF445P59923 1031 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PTENP60484 403 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GTF2BQ00403 316 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 STRN3Q13033 797 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 LPIN1Q14693 890 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SHHQ15465 462 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MAPK6Q16659 721 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF365Q70YC5 407 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ADSSL1Q8N142 457 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SCFD1Q8WVM8 642 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KCNN1Q92952 543 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 OSMRQ99650 979 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 STRA6Q9BX79 667 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM206Q9H813 350 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TBX20Q9UMR3 447 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 EXOC7Q9UPT5 735 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MYH11P35749 1972 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 GBF1Q92538 1859 aa7.36□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ERLIN2O94905 339 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PRKCBP05771 671 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PFKMP08237 780 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MBTD1Q05BQ5 628 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PAK1Q13153 545 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TDHQ8IZJ6 230 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 HERVK_113Q902F9 699 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 BICD1Q96G01 975 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 ACCSQ96QU6 501 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 TSPY26PQ9H489 355 aa7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PRPF8-210ENST00000574217 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms