RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDND1	Q9NY35	253 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246	ARID2	Q68CP9	1835 aa		12.53	□□□□□ -0.4
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WWV3	80 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GRM6	O15303	877 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	12.52	□□□□□ -0.41	2e-9	■□□□□ 8.9
TTLL3-231	ENST00000496246	ALDH2	P05091	517 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGB1	P05556	798 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCB3	Q01970	1234 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	STRN3	Q13033	797 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TMC7	Q7Z402	723 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CABP7	Q86V35	215 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	IGFLR1	Q9H665	355 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TLE6	Q9H808	572 aa		12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246		K7ERI5	159 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	STX6	O43752	255 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TSPAN1	O60635	241 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKCB	P05771	671 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SYT1	P21579	422 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SCP2	P22307	547 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNA5	P22460	613 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ABCD1	P33897	745 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFV1	P49821	464 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PARP2	Q9UGN5	583 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	COL6A3	P12111	3177 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246		E9PMD0	336 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM187B	Q17R55	369 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LPP	Q93052	612 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CPB2	Q96IY4	423 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TCF25	Q9BQ70	676 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CWH43	Q9H720	699 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	IPP	Q9Y573	584 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GUA9	196 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ACKR2	O00590	384 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	OFD1	O75665	1012 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NPTXR	O95502	500 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PEX3	P56589	373 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	BCAR1	P56945	870 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	STK38	Q15208	465 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH23	Q9H251	3354 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PP2D1	A8MPX8	630 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	HIP1R	O75146	1068 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	POMC	P01189	267 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G4B	P0C869	781 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-231	ENST00000496246	GUCY2C	P25092	1073 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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