RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ADCY1Q08828 1119 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 HYIQ5T013 277 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 H2AFVQ71UI9 128 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 FBF1Q8TES7 1133 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 CNKSR1Q969H4 720 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 PGM2Q96G03 612 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ERP44Q9BS26 406 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 RSPH10B2B2RC85 870 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 H0Y3Z8 333 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 FLOT1O75955 427 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 RSPH10BP0C881 870 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ABCB4P21439 1286 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SLC12A3P55017 1021 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ABCB11O95342 1321 aa14.51□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 F5H6K3 240 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ALADP13716 330 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A1P19634 815 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 POLD1P28340 1107 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KLRC3Q07444 240 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 LENG9Q96B70 501 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 AGTP01019 485 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 GBP1P32455 592 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 HSPA1LP34931 641 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 RAD23BP54727 409 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 VPS36Q86VN1 386 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 FITM2Q8N6M3 262 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TRIM7Q9C029 511 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 NDUFB10O96000 172 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 HOXD13P35453 343 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 RAB27AP51159 221 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KCNH2Q12809 1159 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 BNIP1Q12981 228 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TRAF1Q13077 416 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ADAM9Q13443 819 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 CNGA2Q16280 664 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 RPS6KA3P51812 740 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KCNA1Q09470 495 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 REEP2Q9BRK0 252 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 A6NHS1 94 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SPATA21Q7Z572 469 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 LONP2Q86WA8 852 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SFR1Q86XK3 245 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 TEKT4Q8WW24 435 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 CCDC17Q96LX7 622 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PRG0 241 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 SFI1A8K8P3 1242 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 AHCYL1O43865 530 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 ECE2O60344 883 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 FESP07332 822 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 NUDT17P0C025 328 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 GIT2Q14161 759 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 DACT2Q5SW24 774 aa14.48□□□□□ -0.09
NISCH-212ENST00000488380 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 478.7 ms