RNA–Protein interactions for RNA: YJL034W

KAR2, Transcript of ATPase involved in protein import into the ER, yeast

Gene KAR2, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR2	YJL034W	GDS1	P41913	522 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YGL101W	P53144	215 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	POP6	P53218	158 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	FHN1	P53279	174 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	TIM44	Q01852	431 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	IRC13	Q08630	104 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	FRE3	Q08905	711 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SPS2	P08459	502 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SEC12	P11655	471 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MTC2	P34246	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SHE1	P38200	338 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	FMO1	P38866	432 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PFS1	P38872	237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ALP1	P38971	573 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ELO1	P39540	310 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	GTT1	P40582	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	QRI7	P43122	407 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	IDS2	P46958	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	OKP1	P53298	406 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MRPS16	Q02608	121 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	REC102	Q02721	264 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	TDA1	Q03533	586 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	OST6	Q03723	332 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SPC19	Q03954	165 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RRN11	Q04712	507 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	GPN3	Q06543	272 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	BMT6	Q12291	365 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RTN2	Q12443	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SKM1	Q12469	655 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RAS1	P01119	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PET54	P10834	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	AAC3	P18238	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YMC1	P32331	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ORC2	P32833	620 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SKN1	P33336	771 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ECM15	P35195	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MIA40	P36046	403 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MNL1	P38888	796 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	CHL4	P38907	458 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RTT105	P40063	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	FMC1	P40491	155 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ATG18	P43601	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RRN9	P53437	365 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PRM15	Q03262	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	AIM36	Q03798	255 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	BUR2	Q05949	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	IPK1	Q06667	281 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	FRE5	Q08908	694 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SPC3	Q12133	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SIR2	P06700	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PHO80	P20052	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	APA2	P22108	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PDR3	P33200	976 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SRX1	P36077	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	TRR2	P38816	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RTS2	P40962	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	PAM16	P42949	149 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	NSE4	P43124	402 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	TOS2	P50078	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YGR067C	P53243	804 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	RNH70	P53331	553 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	ERV29	P53337	310 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	SWS2	P53937	143 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YFT2	Q06676	274 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	THI73	Q07904	523 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KAR2	YJL034W	STE12	P13574	688 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.7 ms