RNA–Protein interactions for RNA: YBR169C

SSE2, Transcript of Member of the heat shock protein 70 (HSP70) family, yeast

Gene SSE2, Length 2,082 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSE2	YBR169C	NDC1	P32500	655 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	DBP8	P38719	431 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ARN1	P38731	627 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	DSE1	P40077	573 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SSU1	P41930	458 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	IRC7	P43623	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YNR062C	P53748	327 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	OCA2	P53949	197 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SCS7	Q03529	384 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	COQ9	Q05779	260 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	COS7	Q07788	383 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	LDB18	Q07887	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	HER1	Q12276	1246 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	FRE7	Q12333	620 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	GAL7	P08431	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	GEX1	P25596	615 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	COT1	P32798	439 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YKL097C	P34245	136 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CSG2	P35206	410 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	MRPL3	P36516	390 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YBR139W	P38109	508 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	FIG1	P38224	298 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CYC2	P38909	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	FAU1	P40099	211 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CFD1	P40558	293 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YJL107C	P42947	387 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SNG1	P46950	547 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	DIA1	P54005	336 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	VPS9	P54787	451 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RSM23	Q01163	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SED5	Q01590	340 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YPL068C	Q02749	293 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PRM15	Q03262	622 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	APC9	Q12107	265 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	NSL1	Q12143	216 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PSY3	Q12318	242 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ATP14	Q12349	124 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	MOT1	P32333	1867 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ATR1	P13090	542 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	APE1	P14904	514 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SLM4	P38247	162 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SHG1	P38337	142 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	LEU5	P38702	357 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YIR035C	P40579	254 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YPT11	P48559	417 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PMT5	P52867	743 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	SWC4	P53201	476 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ATP23	P53722	227 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ACL4	Q03771	387 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	AIM32	Q04689	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PEX10	Q05568	337 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YLR283W	Q05867	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YOP1	Q12402	180 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	AFI1	Q99222	893 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CCH1	P50077	2039 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RHB1	P25378	209 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YOX1	P34161	385 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	YPK3	P38070	525 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	AME1	P38313	324 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	EFM4	P40516	257 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CHS6	P40955	746 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	LCB2	P40970	561 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	AGP3	P43548	558 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	PHO86	P46956	311 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ERV14	P53173	138 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	TIM21	P53220	239 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	CTF19	Q02732	369 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	ROY1	Q04847	553 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SSE2	YBR169C	NEJ1	Q06148	342 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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