RNA–Protein interactions for RNA: YBL093C

ROX3, Transcript of Subunit of the RNA polymerase II mediator complex, yeast

Gene ROX3, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROX3	YBL093C	ATF1	P40353	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YIL086C	P40503	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	QRI7	P43122	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SWP82	P43554	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IRC5	P43610	853 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TOS2	P50078	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TPC1	P53257	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YGR168C	P53293	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ARP10	Q04549	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	BSC6	Q08280	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SIA1	Q12212	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	HER1	Q12276	1246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YCR100C	P25606	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ITR2	P30606	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MTC7	P32633	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MRPL15	P36523	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	FES1	P38260	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ECM34	P38728	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SBE22	P38814	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	PAC2	P39937	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MIT1	P40002	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YJR120W	P47157	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YGR266W	P53326	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	NRM1	P53718	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	GSH2	Q08220	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	CRT10	Q08226	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	BAR1	P12630	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	HIR2	P32480	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ECM15	P35195	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YPK3	P38070	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ARN2	P38724	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	PEX18	P38855	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ICE2	P40499	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SMK1	P41808	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SPG5	P42933	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SRL4	Q03085	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	INP1	Q03694	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TRS23	Q03784	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	GAL83	Q04739	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ELP6	Q04868	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IRA2	P19158	3079 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	STE4	P18851	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SNF6	P18888	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TAF14	P35189	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	VPS51	P36116	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	FLO10	P36170	1169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YBR139W	P38109	508 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	EFM3	P47163	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TRM9	P49957	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	COS1	P53822	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ASI1	P54074	624 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	NUP49	Q02199	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YML122C	Q03207	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ARV1	Q06541	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	TPO4	Q12256	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
ROX3	YBL093C	GPI12	P23797	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	PBN1	P25580	416 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	IRC7	P43623	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ROX3	YBL093C	SHE4	P51534	789 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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