RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBR7Q8N806 425 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC5A5Q92911 643 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL8AQ96BM9 186 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCF25Q9BQ70 676 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOX7Q9BT81 388 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL23AQ9NPF7 189 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.33□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLSCR1O15162 318 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP27B1O15528 508 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 KDM1AO60341 852 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TACR2P21452 398 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSD3B2P26439 372 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDF5P43026 501 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPEPPSP55786 919 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD69Q07108 199 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 STRN3Q13033 797 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRHR2Q13324 411 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXE3Q13461 319 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDE2Q6IQ49 451 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP51Q70EK9 711 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GAB3Q8WWW8 586 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC1Q99614 292 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRP2O60462 931 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FZD7O75084 574 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PFKMP08237 780 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GAAP10253 952 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACRV1P26436 265 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAM8P78325 824 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 DGCR2P98153 550 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHCR24Q15392 516 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASSF3Q86WH2 238 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC16A11Q8NCK7 471 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MIEF2Q96C03 454 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPC1Q9H2F5 836 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFT22Q9H7X7 185 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ING3Q9NXR8 418 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRRDQ9UH36 339 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NEMP1O14524 444 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZEB2O60315 1214 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFAP3LO75121 409 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALDH1A2O94788 518 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 LY86O95711 162 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 BPIP17213 487 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOX5P35711 763 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ID4P47928 161 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 NRG3P56975 720 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPARAQ07869 468 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CT83Q5H943 113 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 LMBR1LQ6UX01 489 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 STRA8Q7Z7C7 330 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF180Q86T96 592 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8N1X5 172 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL17DQ8TAD2 202 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF503Q96F45 646 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAAP1Q9H8G2 361 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 ULK1O75385 1050 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 LPLP06858 475 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1SP09871 688 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MASP1P48740 699 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR15P49685 360 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTH1RQ03431 593 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 MGAT5Q09328 741 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPIDRQ14159 915 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-38P-201ENST00000384085 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 125.9 ms