RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634724.1

QARS-233, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene QARS, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-233	ENST00000634724	SYT1	P21579	422 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	NPEPPS	P55786	919 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	AK8	Q96MA6	479 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.14	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SLC26A4	O43511	780 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	STX6	O43752	255 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	UPP2	O95045	317 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PHKA2	P46019	1235 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	RARRES1	P49788	294 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	GJD3	Q8N144	294 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SAMD11	Q96NU1	681 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	MYH11	P35749	1972 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	HOXA2	O43364	376 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	MED24	O75448	989 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724		A0A087WZ62	844 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ENPP3	O14638	875 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ERLIN2	O94905	339 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SKI	P12755	728 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	RAB27A	P51159	221 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	DRP2	Q13474	957 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	ADAM2	Q99965	735 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.11	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LINC01553	A4QN01	128 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	TXLNA	P40222	546 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	REST	Q13127	1097 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	BECN1	Q14457	450 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
QARS-233	ENST00000634724	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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