RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 LAD1O00515 517 aa13.29□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 FAM107AO95990 144 aa13.29□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 KCNB1Q14721 858 aa13.29□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa13.29□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ZBTB33Q86T24 672 aa13.29□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 LRRC43Q8N309 656 aa13.29□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 NUMBP49757 651 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 RAD23BP54727 409 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 SEZ6Q53EL9 994 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 NUP85Q9BW27 656 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 KBTBD4Q9NVX7 518 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM120BA0PK00 339 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 CASP5P51878 434 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 CUL1Q13616 776 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 EHMT1Q9H9B1 1298 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 TXNDC16Q9P2K2 825 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ALG6Q9Y672 507 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 SHBGP04278 402 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 GALNT17Q6IS24 598 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ABCB11O95342 1321 aa13.28□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 RFX7Q2KHR2 1363 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 AKAP3O75969 853 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 EPHB1P54762 984 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 QPCTQ16769 361 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 IL31Q6EBC2 164 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 BARGINQ6ZT62 677 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC20A1Q8WUM9 679 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ERP27Q96DN0 273 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 GJA3Q9Y6H8 435 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 REREQ9P2R6 1566 aa13.27□□□□□ -0.28
TRIOBP-211ENST00000492485 PLS3P13797 630 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 RASSF2P50749 326 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 AMPD2Q01433 879 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 TRPC3Q13507 836 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 JAMLQ86YT9 394 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC13A1Q9BZW2 595 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 MED24O75448 989 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 CNGA1P29973 690 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 SERPINB6P35237 376 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 NAB2Q15742 525 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 MMGT1Q8N4V1 131 aa13.27□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 TRPA1O75762 1119 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 UBOX5O94941 541 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 COMTP21964 271 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 ATP5DP30049 168 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 IGBP1P78318 339 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 CLUL1Q15846 466 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 RINT1Q6NUQ1 792 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 NOD2Q9HC29 1040 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 CCPG1Q9ULG6 757 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 CCDC78A2IDD5 438 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 F5H6K3 240 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 AGPSO00116 658 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 ZBTB5O15062 677 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 POLR2MP0CAP2 368 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 SCTRP47872 440 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 LIG4P49917 911 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 IL9RQ01113 521 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 KRT17Q04695 432 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 KLRC3Q07444 240 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 NFIAQ12857 509 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 GBP5Q96PP8 586 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM237Q96Q45 408 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 ERGIC2Q96RQ1 377 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 RUSC1Q9BVN2 902 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 GPRC5CQ9NQ84 441 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 SOX10P56693 466 aa13.26□□□□□ -0.29
TRIOBP-211ENST00000492485 ASPRV1Q53RT3 343 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms