RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	PFKM	P08237	780 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PDGFRB	P09619	1106 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ENPP1	P22413	925 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CNR2	P34972	360 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ETV4	P43268	484 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	GPR3	P46089	330 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	UGT8	Q16880	541 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KATNBL1	Q9H079	304 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	MYBL2	P10244	700 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	LGALS4	P56470	323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PPARA	Q07869	468 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	GAB3	Q8WWW8	586 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	MBD6	Q96DN6	1003 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CSF2RB	P32927	897 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	MEOX1	P50221	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PCOLCE	Q15113	449 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CLUL1	Q15846	466 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ORAI2	Q96SN7	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CEP89	Q96ST8	783 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	TNKS	O95271	1327 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	B4GALT4	O60513	344 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	OSM	P13725	252 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	MRE11	P49959	708 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	CDK17	Q00537	523 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	INAVA	Q3KP66	663 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	GGN	Q86UU5	652 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	WDR92	Q96MX6	357 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SOX7	Q9BT81	388 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	5.74	□□□□□ -1.49	2e-6	■■■□□ 18.8
RBM39-231	ENST00000477334	MKS1	Q9NXB0	559 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	DPP7	Q9UHL4	492 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	B4GALT3	O60512	393 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ITGB3	P05106	788 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ADAM15	Q13444	863 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF827	Q17R98	1081 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	GAREM2	Q75VX8	874 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBM39-231	ENST00000477334	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49

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