RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W YGR035CP53222 116 aa7.48□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W TY1A-BLQ12266 440 aa7.48□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W ESS1P22696 170 aa7.47□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W LSC2P53312 427 aa7.47□□□□□ -1.21
NSE4YDL105W YIR007WP40566 764 aa7.46□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W UBP2Q01476 1272 aa7.46□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W MTC5Q03897 1148 aa7.46□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W YBL086CP38177 466 aa7.45□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W AAD14P42884 376 aa7.45□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W YJU3P28321 313 aa7.42□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W RSC30P38781 883 aa7.42□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W HPF1Q05164 967 aa7.42□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
NSE4YDL105W GLC3P32775 704 aa7.39□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W YJR098CP47139 656 aa7.38□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W APP1P53933 587 aa7.37□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W YPR204WQ08995 1032 aa7.36□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W ARG8P18544 423 aa7.35□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W DLD1P32891 587 aa7.35□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W AIM7Q12156 149 aa7.35□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W TCB1Q12466 1186 aa7.35□□□□□ -1.23
NSE4YDL105W OSH7P38755 437 aa7.33□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W DPH6Q12429 685 aa7.33□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W KTR1P27810 393 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W ROG3P43602 733 aa7.32□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W ITT1Q04638 464 aa7.32□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W MKS1P34072 584 aa7.31□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W FIG4P42837 879 aa7.31□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W TY1A-MR1Q04215 440 aa7.31□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W CSN12P47130 423 aa7.3□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W ICP55P40051 511 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W BDS1Q08347 646 aa7.28□□□□□ -1.24
NSE4YDL105W LYS5P50113 272 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W DFG5Q05031 458 aa7.27□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W TEC1P18412 486 aa7.26□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W RAD59Q12223 238 aa7.25□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W CCP1P00431 361 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W FBP26P32604 452 aa7.24□□□□□ -1.25
NSE4YDL105W STE6P12866 1290 aa7.21□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W VTC4P47075 721 aa7.21□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W PHM7Q12252 991 aa7.21□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W JJJ3P47138 172 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W YPR084WQ06821 456 aa7.2□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W LEU3P08638 886 aa7.19□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W CDC19P00549 500 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W GUT2P32191 649 aa7.18□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W ISU1Q03020 165 aa7.16□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W ATG20Q07528 640 aa7.15□□□□□ -1.26
NSE4YDL105W DAL1P32375 460 aa7.14□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W KIN1P13185 1064 aa7.13□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W DLD3P39976 496 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W STE20Q03497 939 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W MDJ1P35191 511 aa7.11□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W NSG2P53898 299 aa7.11□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W CUZ1P53899 274 aa7.11□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W RPN1P38764 993 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W FRA1Q07825 749 aa7.1□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W AI1P03875 834 aa7.09□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W CEM1P39525 442 aa7.09□□□□□ -1.27
NSE4YDL105W THI72Q08579 599 aa7.07□□□□□ -1.28
NSE4YDL105W MRX12P47084 519 aa7.06□□□□□ -1.28
NSE4YDL105W UBP15P50101 1230 aa7.06□□□□□ -1.28
NSE4YDL105W MSN5P52918 1224 aa7.05□□□□□ -1.28
NSE4YDL105W CSE4P36012 229 aa7.04□□□□□ -1.28
NSE4YDL105W YFL066CP43538 392 aa7.03□□□□□ -1.28
NSE4YDL105W DIT1P21623 536 aa7.02□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W ADE12P80210 433 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W SYT1Q06836 1226 aa7.01□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W WTM2Q12206 467 aa7.01□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W SSN3P39073 555 aa7□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa6.99□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W DAT1P13483 248 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W UTR2P32623 467 aa6.98□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W SLA1P32790 1244 aa6.98□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W AHP1P38013 176 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W CCT8P47079 568 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W TBS1P38114 1094 aa6.97□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W EMP47P43555 445 aa6.97□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W APL6P46682 809 aa6.97□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W YPR053CQ6Q5F3 151 aa6.97□□□□□ -1.29
NSE4YDL105W HPC2Q01448 625 aa6.95□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W MCM16Q12262 181 aa6.95□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W TY1A-DR3Q12441 440 aa6.94□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W ISF1P32488 338 aa6.92□□□□□ -1.3
NSE4YDL105W YBL036CP38197 257 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms