RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
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TNS1-221ENST00000615025 HMMRO75330 724 aa13.74□□□□□ -0.21
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TNS1-221ENST00000615025 EVA1CP58658 441 aa13.74□□□□□ -0.21
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TNS1-221ENST00000615025 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.69□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 SMARCA4P51532 1647 aa13.69□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 NLRP13Q86W25 1043 aa13.69□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 EVC2Q86UK5 1308 aa13.68□□□□□ -0.22
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TNS1-221ENST00000615025 FAM69CQ0P6D2 419 aa13.66□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.66□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 KIF15Q9NS87 1388 aa13.66□□□□□ -0.22
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TNS1-221ENST00000615025 PRM3Q9NNZ6 103 aa13.65□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.65□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 PANK3Q9H999 370 aa13.65□□□□□ -0.22
TNS1-221ENST00000615025 GBP4Q96PP9 640 aa13.65□□□□□ -0.22
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TNS1-221ENST00000615025 TOMM22Q9NS69 142 aa13.64□□□□□ -0.23
TNS1-221ENST00000615025 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.64□□□□□ -0.23
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TNS1-221ENST00000615025 PSME1Q06323 249 aa13.62□□□□□ -0.23
TNS1-221ENST00000615025 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.62□□□□□ -0.23
TNS1-221ENST00000615025 TEFQ10587 303 aa13.62□□□□□ -0.23
TNS1-221ENST00000615025 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.62□□□□□ -0.23
TNS1-221ENST00000615025 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
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TNS1-221ENST00000615025 DEKP35659 375 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
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TNS1-221ENST00000615025 NGEFQ8N5V2 710 aa13.58□□□□□ -0.24
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TNS1-221ENST00000615025 CEP89Q96ST8 783 aa13.56□□□□□ -0.24
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TNS1-221ENST00000615025 PRDM2Q13029 1718 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-221ENST00000615025 KIF3AQ9Y496 699 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS1-221ENST00000615025 KIF16BQ96L93 1317 aa13.55□□□□□ -0.24
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TNS1-221ENST00000615025 USP47Q96K76 1375 aa13.54□□□□□ -0.24
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TNS1-221ENST00000615025 ST18O60284 1047 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-221ENST00000615025 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS1-221ENST00000615025 E9PSI1 815 aa13.53□□□□□ -0.24
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TNS1-221ENST00000615025 NECTIN2Q92692 538 aa13.5□□□□□ -0.25
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TNS1-221ENST00000615025 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
TNS1-221ENST00000615025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.255e-7■■■■■ 40.1
TNS1-221ENST00000615025 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
TNS1-221ENST00000615025 VPS37DQ86XT2 251 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-221ENST00000615025 USP35Q9P2H5 1018 aa13.49□□□□□ -0.25
TNS1-221ENST00000615025 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.49□□□□□ -0.25
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