RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa19.27■□□□□ 0.68
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CAPNS1-209ENST00000590049 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-209ENST00000590049 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-209ENST00000590049 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CAPNS1-209ENST00000590049 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
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CAPNS1-209ENST00000590049 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
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CAPNS1-209ENST00000590049 HRCP23327 699 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.84■□□□□ 0.61
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CAPNS1-209ENST00000590049 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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CAPNS1-209ENST00000590049 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.74■□□□□ 0.59
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CAPNS1-209ENST00000590049 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.74■□□□□ 0.59
CAPNS1-209ENST00000590049 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.73■□□□□ 0.59
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-209ENST00000590049 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CAPNS1-209ENST00000590049 ADAMTS2O95450 1211 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 BRINP3Q76B58 766 aa18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
CAPNS1-209ENST00000590049 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.69■□□□□ 0.58
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