RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 PROX2Q3B8N5 592 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRM-204ENST00000577468 PHF14O94880 888 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 COL9A1P20849 921 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 BCAMP50895 628 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 KCNC4Q03721 635 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZNB5 142 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 LAPTM4AQ15012 233 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 EPAS1Q99814 870 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 WBP1LQ9NX94 342 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRM-204ENST00000577468 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 LRCH3Q96II8 777 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 CAMK2BQ13554 666 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 PACS2Q86VP3 889 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-204ENST00000577468 GFRA3O60609 400 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 PPP4CP60510 307 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 DPYSL4O14531 572 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 DDX12PQ92771 950 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 TSKSQ9UJT2 592 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 LCE2BO14633 110 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K7O43318 606 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 IL21Q9HBE4 155 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-204ENST00000577468 NBR1Q14596 966 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 CERKQ8TCT0 537 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS12P56730 875 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 MTRQ99707 1265 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 PDIA6Q15084 440 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 NBPF26B4DH59 902 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 NECTIN2Q92692 538 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 TATDN2Q93075 761 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 SMAPO00193 183 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-204ENST00000577468 GGCXP38435 758 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 PNMA3Q9UL41 463 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF787Q6DD87 383 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF516Q92618 1163 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 APLP1P51693 650 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 C3orf80F5H4A9 247 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 RNF40O75150 1001 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 SLF2Q8IX21 1173 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-204ENST00000577468 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 SLC4A3P48751 1232 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 E2F4Q16254 413 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 PRR14Q9BWN1 585 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 OSBPP22059 807 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 COPS2P61201 443 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 TTC13Q8NBP0 860 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 ZPR1O75312 459 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 SLC19A1P41440 591 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 DGAT1O75907 488 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 WDR70Q9NW82 654 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 RNF223E7ERA6 249 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PRR20EP86478 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PRR20CP86479 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PRR20DP86480 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PRR20BP86481 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PRR20AP86496 221 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PKDCCQ504Y2 493 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 PADI6Q6TGC4 694 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRM-204ENST00000577468 EYA1Q99502 592 aa6.45□□□□□ -1.38
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