RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-208ENST00000560725 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-208ENST00000560725 ARXQ96QS3 562 aa11.41□□□□□ -0.58
TMOD3-208ENST00000560725 CERKQ8TCT0 537 aa11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-208ENST00000560725 GOPCQ9HD26 462 aa11.4□□□□□ -0.58
TMOD3-208ENST00000560725 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.39□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 CLCN1P35523 988 aa11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 FOSBP53539 338 aa11.37□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 DOK7Q18PE1 504 aa11.37□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 RIMBP2O15034 1052 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.34□□□□□ -0.59
TMOD3-208ENST00000560725 MS4A1P11836 297 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.33□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 OATP04181 439 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.32□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 PADI6Q6TGC4 694 aa11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 NUDT7P0C024 238 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 FLIIQ13045 1269 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 PHOX2BQ99453 314 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 ZMYND15Q9H091 742 aa11.28□□□□□ -0.6
TMOD3-208ENST00000560725 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.27□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 TTC13Q8NBP0 860 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.26□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 ARSIQ5FYB1 569 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 HOMEZQ8IX15 550 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 GPR153Q6NV75 609 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 PRSS12P56730 875 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 POTEJP0CG39 1038 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 FAM161AQ3B820 660 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD3-208ENST00000560725 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.2□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.18□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 LHX6Q9UPM6 363 aa11.17□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.16□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 SNPHO15079 494 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP7Q8WX94 980 aa11.15□□□□□ -0.62
TMOD3-208ENST00000560725 POTEB2H3BUK9 544 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 PTPREP23469 700 aa11.14□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 NBPF26B4DH59 902 aa11.12□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 COL9A1P20849 921 aa11.11□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.11□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 MCM6Q14566 821 aa11.1□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 SULF1Q8IWU6 871 aa11.1□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 EYA1Q99502 592 aa11.1□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 RCCD1A6NED2 376 aa11.09□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.09□□□□□ -0.63
TMOD3-208ENST00000560725 DNAJB2P25686 324 aa11.08□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.08□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.08□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 TSKSQ9UJT2 592 aa11.08□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 A6NJR5 290 aa11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 KCNH8Q96L42 1107 aa11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.07□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 PACS2Q86VP3 889 aa11.06□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 CD46P15529 392 aa11.05□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.05□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 TATDN2Q93075 761 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 PNMA3Q9UL41 463 aa11.04□□□□□ -0.64
TMOD3-208ENST00000560725 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.02□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.01□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 DDX11L8A8MPP1 907 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 BANK1Q8NDB2 785 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11□□□□□ -0.65
TMOD3-208ENST00000560725 KCNK17Q96T54 332 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms