RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525811.5

GMDS-AS1-204, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 539 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RXRBP28702 533 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PLXNC1O60486 1568 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PREX2Q70Z35 1606 aa14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 JCADQ9P266 1359 aa14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 A2MP01023 1474 aa14.5□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ATP7AQ04656 1500 aa14.48□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RGS12O14924 1447 aa14.47□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CLIP1P30622 1438 aa14.46□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.46□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PZPP20742 1482 aa14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NLRP1Q9C000 1473 aa14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FOXD1Q16676 465 aa14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.44□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.43□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.43□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TMEM94Q12767 1356 aa14.42□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 IFFO2Q5TF58 517 aa14.41□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.41□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MIA2Q96PC5 1412 aa14.41□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.41□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MAP3K1Q13233 1512 aa14.4□□□□□ -0.1
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.39□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SHPRHQ149N8 1683 aa14.38□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 AFF2P51816 1311 aa14.38□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 22.6
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LRP5O75197 1615 aa14.37□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.36□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.35□□□□□ -0.11
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TIAM1Q13009 1591 aa14.33□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.32□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SLAIN2Q9P270 581 aa14.31□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 LTKP29376 864 aa14.3□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.3□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MSH6P52701 1360 aa14.3□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KIF3BO15066 747 aa14.28□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 FMN1Q68DA7 1419 aa14.28□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.28□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
GMDS-AS1-204ENST00000525811 YY1P25490 414 aa14.27□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NCOA2Q15596 1464 aa14.26□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 EP400Q96L91 3159 aa14.26□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.25□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 C8orf37Q96NL8 207 aa14.25□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KCNA6P17658 529 aa14.24□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.24□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DIP2AQ14689 1571 aa14.23□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SLIT1O75093 1534 aa14.23□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ERVK-7P63135 1459 aa14.22□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.22□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NWD1Q149M9 1564 aa14.22□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.21□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NGLY1Q96IV0 654 aa14.21□□□□□ -0.13
GMDS-AS1-204ENST00000525811 EID1Q9Y6B2 187 aa14.2□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ABCC3O15438 1527 aa14.2□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.19□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.19□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CCDC125Q86Z20 511 aa14.17□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.15□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.15□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.15□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.15□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CEP152O94986 1710 aa14.13□□□□□ -0.15
GMDS-AS1-204ENST00000525811 PIK3C2BO00750 1634 aa14.13□□□□□ -0.15
GMDS-AS1-204ENST00000525811 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.12□□□□□ -0.15
GMDS-AS1-204ENST00000525811 TET3O43151 1660 aa14.12□□□□□ -0.15
GMDS-AS1-204ENST00000525811 C14orf37Q86TY3 774 aa14.12□□□□□ -0.15
GMDS-AS1-204ENST00000525811 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.12□□□□□ -0.15
GMDS-AS1-204ENST00000525811 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms