RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 AMHR2Q16671 573 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 OTUD5Q96G74 571 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 LHX6Q9UPM6 363 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-677P-201ENST00000516914 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 SNPHO15079 494 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TTC13Q8NBP0 860 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 CERKQ8TCT0 537 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PADI6Q6TGC4 694 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PHOX2BQ99453 314 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 LHX8Q68G74 356 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 COL9A1P20849 921 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM117AQ9C073 453 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRSS12P56730 875 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM161AQ3B820 660 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 IL27Q8NEV9 243 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 MS4A1P11836 297 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 PTPREP23469 700 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 OATP04181 439 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 CLCN1P35523 988 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 TSKSQ9UJT2 592 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 C3orf80F5H4A9 247 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 NLRP7Q8WX94 980 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-677P-201ENST00000516914 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 ST18O60284 1047 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCNK17Q96T54 332 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 EYA1Q99502 592 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 PROX2Q3B8N5 592 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 GOPCQ9HD26 462 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 ERBB3P21860 1342 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 RCCD1A6NED2 376 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 NBPF26B4DH59 902 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 PSEN2P49810 448 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 EMP3P54852 163 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 TATDN2Q93075 761 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 ARHGAP33O14559 1287 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 MARVELD3Q96A59 401 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 PNMA3Q9UL41 463 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEB3A0JP26 581 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 DNAJB2P25686 324 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 PBX2P40425 430 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 POTEBQ6S5H4 581 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 PACS2Q86VP3 889 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCNH8Q96L42 1107 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 SMAPO00193 183 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM205CA6NFA0 338 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 CD46P15529 392 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 C14orf37Q86TY3 774 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms