RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 TRIM52Q96A61 297 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC1P33527 1531 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 CCDC125Q86Z20 511 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.52□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 PRXQ9BXM0 1461 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 NLRP1Q9C000 1473 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ATP7AQ04656 1500 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 PLXNC1O60486 1568 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 TNRQ92752 1358 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 KIF14Q15058 1648 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 PHLPP1O60346 1717 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 P3H3Q8IVL6 736 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 LRP6O75581 1613 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 SHPRHQ149N8 1683 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 PZPP20742 1482 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC3O15438 1527 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 RGS12O14924 1447 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 MIA2Q96PC5 1412 aa7.46□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.46□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 NWD1Q149M9 1564 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 A2MP01023 1474 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NGLY1Q96IV0 654 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 YY1P25490 414 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 EP400Q96L91 3159 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 MAP3K1Q13233 1512 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 PREX2Q70Z35 1606 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 TMEM94Q12767 1356 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 CLIP1P30622 1438 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 GGT6Q6P531 493 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SLAIN2Q9P270 581 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 AFF2P51816 1311 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 MSH6P52701 1360 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 KCNA6P17658 529 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SLIT1O75093 1534 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 TIAM1Q13009 1591 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 DIP2AQ14689 1571 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 HRCP23327 699 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 EID1Q9Y6B2 187 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 FMN1Q68DA7 1419 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 LTKP29376 864 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 DSG3P32926 999 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00491-204ENST00000513815 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00491-204ENST00000513815 NCOA2Q15596 1464 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00491-204ENST00000513815 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms