RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ETV1-223	ENST00000497115	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	NUDT7	P0C024	238 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	GPR153	Q6NV75	609 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	C14orf37	Q86TY3	774 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ETV1-223	ENST00000497115	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	CLCN1	P35523	988 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	OAT	P04181	439 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.85	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	SNPH	O15079	494 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ETV1-223	ENST00000497115	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.83	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	MS4A1	P11836	297 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	LHX6	Q9UPM6	363 aa		11.82	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	PRSS12	P56730	875 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.8	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	PTPRE	P23469	700 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	COL9A1	P20849	921 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ETV1-223	ENST00000497115	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	EYA1	Q99502	592 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	TSKS	Q9UJT2	592 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.67	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.66	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
ETV1-223	ENST00000497115	FLII	Q13045	1269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.64	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	DNAJB2	P25686	324 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	TATDN2	Q93075	761 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	KCNK17	Q96T54	332 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ETV1-223	ENST00000497115	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	CD46	P15529	392 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	PROX2	Q3B8N5	592 aa		11.56	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.55	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	LHX8	Q68G74	356 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ETV1-223	ENST00000497115	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	PBX2	P40425	430 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	ARX	Q96QS3	562 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	ERBB3	P21860	1342 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ETV1-223	ENST00000497115	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.51	□□□□□ -0.57

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