RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.13■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSCBQ8IWL3 235 aa21.13■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PANK3Q9H999 370 aa21.12■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNJ2O15056 1496 aa21.11■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGD1P98174 961 aa21.11■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLIN1O60240 522 aa21.1■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUTM2FA1L443 756 aa21.09■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HECW1Q76N89 1606 aa21.09■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.09■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQGAP2Q13576 1575 aa21.08■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.07■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.07■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF15Q9NS87 1388 aa21.06■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIA2Q96PC5 1412 aa21.06■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.06■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.04■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.03■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP47Q96K76 1375 aa21.01■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC6Q8TAG9 804 aa21■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 50.9
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K1Q13233 1512 aa21■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE3BQ13370 1112 aa21■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIN2AQ12879 1464 aa20.99■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.98■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HFM1A2PYH4 1435 aa20.96■□□□□ 0.95
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A3P48751 1232 aa20.94■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.94■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APAF1O14727 1248 aa20.94■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.94■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPHP1O15259 732 aa20.93■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.93■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.93■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.92■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCCP23508 829 aa20.9■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.9■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRBNQ96SW2 442 aa20.89■□□□□ 0.94
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.89■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COG6Q9Y2V7 657 aa20.88■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE4AP27815 886 aa20.87■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK31Q9BXU1 1019 aa20.87■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AFAP1Q8N556 730 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.86■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAPK1P53355 1430 aa20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.84■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.83■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.82■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMPHP49418 695 aa20.82■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC7Q96M83 1385 aa20.82■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAIPQ13075 1403 aa20.81■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GBP4Q96PP9 640 aa20.81■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.8■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAC3Q96MF2 364 aa20.78■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ROCK1Q13464 1354 aa20.77■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E9PSI1 815 aa20.77■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.77■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP44Q96MT7 982 aa20.76■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.75■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EID1Q9Y6B2 187 aa20.75■□□□□ 0.91
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