RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRF-209ENST00000438120 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRF-209ENST00000438120 PANK3Q9H999 370 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRF-209ENST00000438120 TOMM22Q9NS69 142 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRF-209ENST00000438120 JPH4Q96JJ6 628 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRF-209ENST00000438120 G3V3G9 751 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 PLIN1O60240 522 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 SMARCA2P51531 1590 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 PDE4CQ08493 712 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PTPRF-209ENST00000438120 NGEFQ8N5V2 710 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.39■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 RILPL2Q969X0 211 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 PTMSP20962 102 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.38■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 KIF15Q9NS87 1388 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 WIZO95785 1651 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 COG3Q96JB2 828 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 PDE3BQ13370 1112 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 SLC4A3P48751 1232 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 TPM4P67936 248 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 NECTIN2Q92692 538 aa21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRF-209ENST00000438120 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 VPS53Q5VIR6 699 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 KIF16BQ96L93 1317 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.32■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.31■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 ST18O60284 1047 aa21.31■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 EVA1CP58658 441 aa21.3■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.3■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 COG6Q9Y2V7 657 aa21.3■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.29■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.28■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 CRBNQ96SW2 442 aa21.28■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 EVC2Q86UK5 1308 aa21.28■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 APAF1O14727 1248 aa21.27■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 MARCH6O60337 910 aa21.27■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PTPRF-209ENST00000438120 TEFQ10587 303 aa21.27■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 MSH5O43196 834 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.26■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.25■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 H3BQV1 296 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 IFFO2Q5TF58 517 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 USP47Q96K76 1375 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 E9PSI1 815 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 PTPRGP23470 1445 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRF-209ENST00000438120 PDE4AP27815 886 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 RAD21O60216 631 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 UACAQ9BZF9 1416 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 RIPK4P57078 832 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 FAM161AQ3B820 660 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 MCTP1Q6DN14 999 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 KIF3AQ9Y496 699 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 PSME1Q06323 249 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRF-209ENST00000438120 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 PHF14O94880 888 aa21.14■□□□□ 0.97
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