RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

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Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.24□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.24□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.22□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 BARGINQ6ZT62 677 aa8.22□□□□□ -1.09
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR37O15354 613 aa8.21□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 DOK7Q18PE1 504 aa8.2□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARSIQ5FYB1 569 aa8.19□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARVELD3Q96A59 401 aa8.19□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR62O43379 1518 aa8.19□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUTM2FA1L443 756 aa8.18□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHF14O94880 888 aa8.18□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.18□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.18□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.18□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT7P0C024 238 aa8.17□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR153Q6NV75 609 aa8.17□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.17□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPAS1Q99814 870 aa8.16□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.15□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.15□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMBP2O15034 1052 aa8.15□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.15□□□□□ -1.1
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.14□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 JPH4Q96JJ6 628 aa8.14□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOSBP53539 338 aa8.13□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTGDRQ13258 359 aa8.13□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.13□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFTRP13569 1480 aa8.13□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K7O43318 606 aa8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 FCHSD2O94868 740 aa8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 FECHP22830 423 aa8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 AK7Q96M32 723 aa8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.12□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNPATO15228 680 aa8.11□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIC1Q14526 733 aa8.11□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.11□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNPHO15079 494 aa8.1□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXW7Q969H0 707 aa8.1□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 LHX6Q9UPM6 363 aa8.1□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP2K5Q13163 448 aa8.09□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEUROD2Q15784 382 aa8.09□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.09□□□□□ -1.11
RPS3AP54-201ENST00000435535 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 IRF6O14896 467 aa8.08□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM66O15016 1216 aa8.08□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.08□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEB3A0JP26 581 aa8.07□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.07□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 POTEBQ6S5H4 581 aa8.07□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC102AQ96A19 550 aa8.07□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 EMP3P54852 163 aa8.05□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE4DQ08499 809 aa8.05□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.05□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHD1O14646 1710 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM205CA6NFA0 338 aa8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOPBP1Q92547 1522 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.03□□□□□ -1.12
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMRN1Q13201 1228 aa8.02□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.02□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.02□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR97A6NE52 1622 aa8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 CERKQ8TCT0 537 aa8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.01□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PADI6Q6TGC4 694 aa8□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL2L12Q9HB09 334 aa8□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PBRM1Q86U86 1689 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL9A1P20849 921 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMHR2Q16671 573 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM161AQ3B820 660 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.99□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC13Q8NBP0 860 aa7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.98□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPREP23469 700 aa7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS12P56730 875 aa7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHOX2BQ99453 314 aa7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.96□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFT140Q96RY7 1462 aa7.95□□□□□ -1.14
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