RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 EVC2Q86UK5 1308 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HMMRO75330 724 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OSCARQ8IYS5 282 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.89■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 CUX1P39880 1505 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 NRDCO43847 1150 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 GBP4Q96PP9 640 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 COG3Q96JB2 828 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRJ-201ENST00000418331 E9PSI1 815 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GPATCH3Q96I76 525 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PLIN1O60240 522 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GORABQ5T7V8 394 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 APAF1O14727 1248 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 NCOA2Q15596 1464 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRJ-201ENST00000418331 PTMSP20962 102 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.76■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 STAC3Q96MF2 364 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC7Q96M83 1385 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIN2BQ13224 1484 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CFTRP13569 1480 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PRDM2Q13029 1718 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ARAP1Q96P48 1450 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRJ-201ENST00000418331 DRC7Q8IY82 874 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CRBNQ96SW2 442 aa26.68■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 COG6Q9Y2V7 657 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNJ1O43426 1573 aa26.67■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 NGEFQ8N5V2 710 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE4AP27815 886 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM161AQ3B820 660 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 TEFQ10587 303 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 MIA2Q96PC5 1412 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 AFAP1Q8N556 730 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 RIPK4P57078 832 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 ST18O60284 1047 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PTPRJ-201ENST00000418331 RUNDC1Q96C34 613 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 NESP48681 1621 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNJ2O15056 1496 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRXQ9BXM0 1461 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 RILPL2Q969X0 211 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-201ENST00000418331 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms