RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 PHF14O94880 888 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCAMP50895 628 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZNB5 142 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNC4Q03721 635 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 COL9A1P20849 921 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU2-38P-201ENST00000410856 LAPTM4AQ15012 233 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 EPAS1Q99814 870 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 WBP1LQ9NX94 342 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 LRCH3Q96II8 777 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAMK2BQ13554 666 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU2-38P-201ENST00000410856 PACS2Q86VP3 889 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPYSL4O14531 572 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU2-38P-201ENST00000410856 GFRA3O60609 400 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP4CP60510 307 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU2-38P-201ENST00000410856 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 MAP3K7O43318 606 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 NBR1Q14596 966 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDX12PQ92771 950 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSKSQ9UJT2 592 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRKD2Q9BZL6 878 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 IL21Q9HBE4 155 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDIA6Q15084 440 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 CERKQ8TCT0 537 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 NBPF26B4DH59 902 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 NECTIN2Q92692 538 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 MTRQ99707 1265 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU2-38P-201ENST00000410856 LCE2BO14633 110 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRSS12P56730 875 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMAPO00193 183 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF40O75150 1001 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 GGCXP38435 758 aa7.3□□□□□ -1.24
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RNU2-38P-201ENST00000410856 PNMA3Q9UL41 463 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 TATDN2Q93075 761 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.27□□□□□ -1.25
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RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC4A3P48751 1232 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 APLP1P51693 650 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF787Q6DD87 383 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF516Q92618 1163 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLF2Q8IX21 1173 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR14Q9BWN1 585 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU2-38P-201ENST00000410856 E2F4Q16254 413 aa7.21□□□□□ -1.26
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RNU2-38P-201ENST00000410856 COPS2P61201 443 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZPR1O75312 459 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 OSBPP22059 807 aa7.17□□□□□ -1.26
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RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR70Q9NW82 654 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 PKDCCQ504Y2 493 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 PADI6Q6TGC4 694 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTC13Q8NBP0 860 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC19A1P41440 591 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 RNF223E7ERA6 249 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 DGAT1O75907 488 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR20EP86478 221 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR20CP86479 221 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR20DP86480 221 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR20BP86481 221 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRR20AP86496 221 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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