RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 NCAPD3P42695 1498 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 PTMSP20962 102 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 GBP4Q96PP9 640 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 GPATCH3Q96I76 525 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 STAC3Q96MF2 364 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 NUTM2FA1L443 756 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 COG3Q96JB2 828 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 GORABQ5T7V8 394 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 CUX1P39880 1505 aa19.89■□□□□ 0.78
SH3BP4-203ENST00000409212 E9PSI1 815 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 NGEFQ8N5V2 710 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP3Q9Y3E7 222 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF21BO75037 1637 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 DRC7Q8IY82 874 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.81■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 40.5
SH3BP4-203ENST00000409212 DEKP35659 375 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 APAF1O14727 1248 aa19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4-203ENST00000409212 GRIN2BQ13224 1484 aa19.77■□□□□ 0.75
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SH3BP4-203ENST00000409212 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 NCOA2Q15596 1464 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 ST18O60284 1047 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC34Q96HJ3 373 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 MIA2Q96PC5 1412 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC7Q96M83 1385 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 CFTRP13569 1480 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP4-203ENST00000409212 PLIN1O60240 522 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF3AQ9Y496 699 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA2012Q0VF49 1180 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM161AQ3B820 660 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD45Q5TZF3 282 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 COG6Q9Y2V7 657 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 CRBNQ96SW2 442 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 RUNDC1Q96C34 613 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 RIPK4P57078 832 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 PRDM2Q13029 1718 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF16BQ96L93 1317 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE4AP27815 886 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 SYNJ2O15056 1496 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 TPM4P67936 248 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 EVA1CP58658 441 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 PSME1Q06323 249 aa19.65■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.64■□□□□ 0.74
SH3BP4-203ENST00000409212 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4-203ENST00000409212 CLSTN1O94985 981 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4-203ENST00000409212 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP4-203ENST00000409212 RILPL2Q969X0 211 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-203ENST00000409212 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.63■□□□□ 0.73
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