RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBR1Q14596 966 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-38P-201ENST00000384085 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP3K7O43318 606 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-38P-201ENST00000384085 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMA3EO15041 775 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 OSBPP22059 807 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAC3Q96MF2 364 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 TK2O00142 265 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 COL9A1P20849 921 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-38P-201ENST00000384085 PROX2Q3B8N5 592 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 HRO43593 1189 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUTM2FA1L443 756 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CERKQ8TCT0 537 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBPF3Q9H094 633 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.79□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS12P56730 875 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-38P-201ENST00000384085 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PACS2Q86VP3 889 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC24A1O60721 1099 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSKSQ9UJT2 592 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTGDRQ13258 359 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PADI6Q6TGC4 694 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 WNT2BQ93097 391 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMAPO00193 183 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 FCHSD2O94868 740 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TATDN2Q93075 761 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PNMA3Q9UL41 463 aa7.71□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBPF26B4DH59 902 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPN5P54829 565 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 HCSTQ9UBK5 93 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 C3orf80F5H4A9 247 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 HIC1Q14526 733 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTC13Q8NBP0 860 aa7.67□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNPATO15228 680 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCAMP50895 628 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM161AQ3B820 660 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRCH3Q96II8 777 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 FECHP22830 423 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 EYA1Q99502 592 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR37O15354 613 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 OATP04181 439 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF40O75150 1001 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP4CP60510 307 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 WBP1LQ9NX94 342 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-38P-201ENST00000384085 RCCD1A6NED2 376 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJB2P25686 324 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC4A3P48751 1232 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCANQ96GW7 911 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLF2Q8IX21 1173 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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