RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375571.5

MAPRE1-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE1, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE1-201ENST00000375571 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.28■■□□□ 1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 CD109Q6YHK3 1445 aa24.28■■□□□ 1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.27■■□□□ 1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.27■■□□□ 1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.27■■□□□ 1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.26■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.25■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 USP47Q96K76 1375 aa24.24■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 ERBINQ96RT1 1412 aa24.23■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 CCDC7Q96M83 1385 aa24.23■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 UNC13BO14795 1591 aa24.22■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.21■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 CCDC184Q52MB2 194 aa24.21■■□□□ 1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 ATP7AQ04656 1500 aa24.19■■□□□ 1.46
MAPRE1-201ENST00000375571 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.19■■□□□ 1.46
MAPRE1-201ENST00000375571 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.18■■□□□ 1.46
MAPRE1-201ENST00000375571 GGT6Q6P531 493 aa24.17■■□□□ 1.46
MAPRE1-201ENST00000375571 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.16■■□□□ 1.46
MAPRE1-201ENST00000375571 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.13■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.12■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.12■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 A2MP01023 1474 aa24.12■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.1■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.09■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 CCER2I3L3R5 266 aa24.08■■□□□ 1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.08■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 E9PCH4 1651 aa24.07■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.07■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.06■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.06■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 KDM5CP41229 1560 aa24.05■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 ATP10AO60312 1499 aa24.05■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.04■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.04■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.02■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.02■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 KANK1Q14678 1352 aa24.02■■□□□ 1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
MAPRE1-201ENST00000375571 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.98■■□□□ 1.43
MAPRE1-201ENST00000375571 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.97■■□□□ 1.43
MAPRE1-201ENST00000375571 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.96■■□□□ 1.43
MAPRE1-201ENST00000375571 DEPDC5O75140 1603 aa23.95■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 CLTCL1P53675 1640 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 MRS2Q9HD23 443 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 PTPRTO14522 1441 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 MYT1Q01538 1121 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.93■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 TSPOAP1O95153 1857 aa23.92■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 TESK2Q96S53 571 aa23.9■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.9■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.9■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.9■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.89■■□□□ 1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.88■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 TET3O43151 1660 aa23.88■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCA6Q8N139 1617 aa23.88■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 TRPM2O94759 1503 aa23.88■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.88■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 CEP152O94986 1710 aa23.87■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.86■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 NEO1Q92859 1461 aa23.85■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 NPATQ14207 1427 aa23.85■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.83■■□□□ 1.41
MAPRE1-201ENST00000375571 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.81■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.81■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 MLECQ14165 292 aa23.8■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.8■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.77■■□□□ 1.4
MAPRE1-201ENST00000375571 RICTORQ6R327 1708 aa23.76■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 BCANQ96GW7 911 aa23.76■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 PANK3Q9H999 370 aa23.76■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.76■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 MADDQ8WXG6 1647 aa23.75■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 DIP2BQ9P265 1576 aa23.75■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 TMF1P82094 1093 aa23.73■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 IDI1Q13907 227 aa23.73■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 NOS1P29475 1434 aa23.72■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
MAPRE1-201ENST00000375571 ABCC3O15438 1527 aa23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms