RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 JPH4Q96JJ6 628 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 EPAS1Q99814 870 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PBX2P40425 430 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
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RABGGTB-202ENST00000370826 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.96□□□□□ -0.98
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZMYND10O75800 440 aa8.93□□□□□ -0.98
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RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.92□□□□□ -0.98
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RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-202ENST00000370826 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-202ENST00000370826 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP33O14559 1287 aa8.9□□□□□ -0.98
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RABGGTB-202ENST00000370826 PTGDRQ13258 359 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-202ENST00000370826 BARGINQ6ZT62 677 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-202ENST00000370826 HCSTQ9UBK5 93 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-202ENST00000370826 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.89□□□□□ -0.99
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RABGGTB-202ENST00000370826 GNPATO15228 680 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 PSEN2P49810 448 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 FECHP22830 423 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPREP23469 700 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 COL9A1P20849 921 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 CERKQ8TCT0 537 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 STAC3Q96MF2 364 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNK17Q96T54 332 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 TK2O00142 265 aa8.81□□□□□ -1
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RABGGTB-202ENST00000370826 HRO43593 1189 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS12P56730 875 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 IRF6O14896 467 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 PADI6Q6TGC4 694 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC13Q8NBP0 860 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH8Q96L42 1107 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 AK7Q96M32 723 aa8.79□□□□□ -1
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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RABGGTB-202ENST00000370826 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.76□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 PROX2Q3B8N5 592 aa8.75□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 TSKSQ9UJT2 592 aa8.75□□□□□ -1.01
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM66O15016 1216 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM161AQ3B820 660 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.74□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPN5P54829 565 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.73□□□□□ -1.01
RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf80F5H4A9 247 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 OATP04181 439 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PACS2Q86VP3 889 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.71□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PHOX2BQ99453 314 aa8.7□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE4DQ08499 809 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 TATDN2Q93075 761 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 EYA1Q99502 592 aa8.69□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 AMHR2Q16671 573 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA3Q9UL41 463 aa8.68□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NBPF26B4DH59 902 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 SMAPO00193 183 aa8.66□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 NEUROD2Q15784 382 aa8.65□□□□□ -1.02
RABGGTB-202ENST00000370826 RCCD1A6NED2 376 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 NLRP7Q8WX94 980 aa8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT2BQ93097 391 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
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