RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 MBD5Q9P267 1494 aa15.87■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.86■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 PZPP20742 1482 aa15.85■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.83■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 TMEM132EQ6IEE7 984 aa15.83■□□□□ 0.13
HPS1-204ENST00000361490 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.83■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 FKBP8Q14318 412 aa15.82■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.81■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 CCDC184Q52MB2 194 aa15.81■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.81■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 TMF1P82094 1093 aa15.81■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.81■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 CCDC7Q96M83 1385 aa15.8■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.8■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
HPS1-204ENST00000361490 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.76■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 ADGRL2O95490 1459 aa15.75■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 PANK3Q9H999 370 aa15.75■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.74■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 POGKQ9P215 609 aa15.74■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.74■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 CCER2I3L3R5 266 aa15.74■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.72■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 PLEKHG5O94827 1062 aa15.72■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.72■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.72■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 SHROOM2Q13796 1616 aa15.71■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.71■□□□□ 0.11
HPS1-204ENST00000361490 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.7■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 NUTM2FA1L443 756 aa15.69■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 PREX2Q70Z35 1606 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.68■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 IDI1Q13907 227 aa15.67■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 ERBINQ96RT1 1412 aa15.66■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 CDCA8Q53HL2 280 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.65■□□□□ 0.1
HPS1-204ENST00000361490 A2MP01023 1474 aa15.64■□□□□ 0.09
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HPS1-204ENST00000361490 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.63■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 NEUROD2Q15784 382 aa15.63■□□□□ 0.09
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HPS1-204ENST00000361490 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.62■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 ABCC1P33527 1531 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.61■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 SOX12O15370 315 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.58■□□□□ 0.09
HPS1-204ENST00000361490 CABP2Q9NPB3 220 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 PLA2R1Q13018 1463 aa15.58■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.57■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 TSPOAP1O95153 1857 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 NOS1P29475 1434 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.55■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 MORC1Q86VD1 984 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.54■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 RALBP1Q15311 655 aa15.53■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 NLRP13Q86W25 1043 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.52■□□□□ 0.08
HPS1-204ENST00000361490 PRAM1Q96QH2 718 aa15.52■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 TESK2Q96S53 571 aa15.51■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 C14orf37Q86TY3 774 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.5■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.49■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.48■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 ATP10AO60312 1499 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 NPATQ14207 1427 aa15.47■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.46■□□□□ 0.07
HPS1-204ENST00000361490 STAC3Q96MF2 364 aa15.46■□□□□ 0.06
HPS1-204ENST00000361490 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
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