RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 RGS22Q8NE09 1264 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.58□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 USP35Q9P2H5 1018 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 MCCP23508 829 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 HFM1A2PYH4 1435 aa6.57□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 NEFMP07197 916 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 TRIM52Q96A61 297 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PTPRKQ15262 1439 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 MIA2Q96PC5 1412 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGEF11O15085 1522 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 CLGNO14967 610 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 FAM193AP78312 1265 aa6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 MMP14P50281 582 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PTPRGP23470 1445 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PSMD1Q99460 953 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 MAPKBP1O60336 1514 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM51Q9NW97 253 aa6.55□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 NAIPQ13075 1403 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.54□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 UACAQ9BZF9 1416 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 PTMSP20962 102 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 TONSLQ96HA7 1378 aa6.53□□□□□ -1.36
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 CHD1O14646 1710 aa6.52□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 DAPK1P53355 1430 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 FKBP8Q14318 412 aa6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 PHF14O94880 888 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ABCA8O94911 1581 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ATP10BO94823 1461 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 CERS3Q8IU89 383 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 AKNAQ7Z591 1439 aa6.5□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 KIF14Q15058 1648 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC5O15440 1437 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ROCK1Q13464 1354 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 TSPY4P0CV99 314 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 TSPY10P0CW01 314 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 KCNH8Q96L42 1107 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.46□□□□□ -1.37
CLVS1-201ENST00000325897 PSEN1P49768 467 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 GSE1Q14687 1217 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 NCOA1Q15788 1441 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 VGLL3A8MV65 326 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 KDM6BO15054 1643 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 SHROOM2Q13796 1616 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ABCC2Q92887 1545 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 APPP05067 770 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ANAPC15P60006 121 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-201ENST00000325897 MAFGO15525 162 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms